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科技服務 Illumina 人DNA甲基化芯片服務
表觀遺傳學研究服務-Illumina 人DNA甲基化芯片服務
DNA甲基化在基因表達調控中扮演著重要的角色,參與生物體多種重要的生命活動。此外,DNA甲基化異常及其對基因表達的影響會導致人類的許多復雜疾病的發生,如癌癥、神經疾病和糖尿病等。為了研究甲基化在人體內的重要作用,加速甲基化研究的臨床進展,Illumina推出了高通量的450k甲基化芯片,并取得巨大成功。在此基礎上,Illumina推出了新一代的升級版甲基化芯片Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡稱850k芯片),為研究者提供了一個更經濟可靠的甲基化研究平臺。
 
Infinium MethylationEPIC BeadChip(簡稱850k芯片)
 
850K芯片可檢測人全基因組約853,307個CpG位點的甲基化狀態,其中包含了原450K芯片91%的位點,并增加了413,745個位點。850K芯片不但保持了對CpG島,基因啟動子區的全面覆蓋,還特別加強了增強子區(來源于ENCODE及FANTOM5的最新研究進展)及基因編碼區的探針覆蓋。可廣泛應用于干細胞研究、腫瘤和其他復雜疾病研究,是更適合于表觀基因組全關聯分析研究(EWAS)的一款芯片。
 
 
850k芯片覆蓋位點
 
1. 涵蓋Infinium Methylation 450 BeadChip芯片中90%以上的位點
2。 CpG島以外的CpG位點
3. 人類干細胞中的非CpG甲基化位點(CHH位點)
4. 正常組織與腫瘤(多種癌癥)組織差異甲基化位點
5. FANTOM5增強子
6. ENCODE開放染色質和增強子
 
7. 脫氧核糖核酸酶超敏位點
8. miRNA啟動子區域
 
 
850k芯片優勢
 
1. 全面的基因組覆蓋范圍:檢測> 850,000個CpG位點,全面覆蓋CpG島、啟動子、編碼區及增強子。
2. 高質量的數據:沿用了450k芯片的Infinium技術,同時采用Infinium I及II探針設計,使檢測范圍最大化。
3. 分辨率高:單堿基分辨率,可以直接檢測到發生甲基化的準確位點。
4. 可重復性高:自身技術重復間的相關性以及與450K相同探針間的相關性R2 > 0.98。
5. 起始模板量低:僅需 250ng,大大節約了樣品量。
6. 適用于FFPE樣本
 
 
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